Taller: Análisis de datos de metilación del TCGA-LUAD

Este repositorio contiene el material práctico, código y flujos de trabajo para el taller de análisis de datos epigenéticos utilizando R y Bioconductor. Nos centraremos en datos de Adenocarcinoma de Pulmón (LUAD) provenientes del programa The Cancer Genome Atlas (TCGA).
Objetivos de aprendizaje: Al finalizar este taller, los participantes serán capaces de realizar un flujo de trabajo completo de análisis bioinformático, incluyendo:
Adquisición de Datos: Descarga y manipulación de datos de microarreglos de metilación (Illumina 450K) específicos del proyecto TCGA-LUAD, enfocándonos exclusivamente en muestras pareadas (mismo paciente).
Anotación y Filtrado: Identificación y selección de sondas CpG situadas estratégicamente en regiones promotoras de genes candidatos de interés.
Análisis Comparativo: Evaluación de diferencias de metilación entre tejido tumoral y tejido normal adyacente.
Estadística y Visualización: Ejecución de pruebas de hipótesis pertinentes y generación de visualizaciones de alto impacto (Boxplots, Heatmaps, etc.) para interpretar los resultados.