Resumen
Most common breast cancer susceptibility variants have been identified through genome-wide association studies (GWAS) of predominantly estrogen receptor (ER)-positive disease1. We conducted a GWAS using 21,468 ER-negative cases and 100,594 controls combined with 18,908 BRCA1 mutation carriers (9,414 with breast cancer), all of European origin. We identified independent associations at P < 5 × 10-8 with ten variants at nine new loci. At P < 0.05, we replicated associations with 10 of 11 variants previously reported in ER-negative disease or BRCA1 mutation carrier GWAS and observed consistent associations with ER-negative disease for 105 susceptibility variants identified by other studies. These 125 variants explain approximately 16% of the familial risk of this breast cancer subtype. There was high genetic correlation (0.72) between risk of ER-negative breast cancer and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers. These findings may lead to improved risk prediction and inform further fine-mapping and functional work to better understand the biological basis of ER-negative breast cancer.
| Idioma original | Inglés |
|---|---|
| Páginas (desde-hasta) | 1767-1778 |
| Número de páginas | 12 |
| Publicación | Nature Genetics |
| Volumen | 49 |
| N.º | 12 |
| DOI | |
| Estado | Publicada - 01 dic 2017 |
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Este resultado contribuye a los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible
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ODS 3: Salud y bienestar
Huella
Profundice en los temas de investigación de 'Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer'. En conjunto forman una huella única.Citar esto
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En: Nature Genetics, Vol. 49, N.º 12, 01.12.2017, p. 1767-1778.
Producción: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva
TY - JOUR
T1 - Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer
AU - Milne, Roger L.
AU - Kuchenbaecker, Karoline B.
AU - Michailidou, Kyriaki
AU - Beesley, Jonathan
AU - Kar, Siddhartha
AU - Lindström, Sara
AU - Hui, Shirley
AU - Lemaçon, Audrey
AU - Soucy, Penny
AU - Dennis, Joe
AU - Jiang, Xia
AU - Rostamianfar, Asha
AU - Finucane, Hilary
AU - Bolla, Manjeet K.
AU - McGuffog, Lesley
AU - Wang, Qin
AU - Aalfs, Cora M.
AU - Abctctb, Investigators
AU - Adams, Marcia
AU - Adlard, Julian
AU - Agata, Simona
AU - Ahmed, Shahana
AU - Ahsan, Habibul
AU - Aittom, Kristiina Äki
AU - Fares, Al Ejeh
AU - Allen, Jamie
AU - Ambrosone, Christine B.
AU - Amos, Christopher I.
AU - Andrulis, Irene L.
AU - Anton-Culver, Hoda
AU - Antonenkova, Natalia N.
AU - Arndt, Volker
AU - Arnold, Norbert
AU - Aronson, Kristan J.
AU - Auber, Bernd
AU - Auer, Paul L.
AU - Ausems, Margreet G.M.
AU - Azzollini, Jacopo
AU - François, Bacot
AU - Balma, Judith Nã
AU - Barile, Monica
AU - Barjhoux, Laure
AU - Barkardottir, Rosa B.
AU - Barrdahl, Myrto
AU - Barnes, Daniel
AU - Barrowdale, Daniel
AU - Baynes, Caroline
AU - Beckmann, Matthias W.
AU - Benitez, Javier
AU - Bermisheva, Marina
AU - Bernstein, Leslie
AU - Bignon, Yves Jean
AU - Blazer, Kathleen R.
AU - Blok, Marinus J.
AU - Blomqvist, Carl
AU - Blot, William
AU - Bobolis, Kristie
AU - Boeckx, Bram
AU - Bogdanova, Natalia V.
AU - Bojesen, Anders
AU - Bojesen, Stig E.
AU - Bonanni, Bernardo
AU - Anne-Lise, Børresen Dale
AU - Bozsik, Aniko
AU - Bradbury, Angela R.
AU - Brand, Judith S.
AU - Brauch, Hiltrud
AU - Brenner, Hermann
AU - Brigitte, Bressac De Paillerets
AU - Brewer, Carole
AU - Brinton, Louise
AU - Broberg, Per
AU - Angela, Brooks Wilson
AU - Brunet, Joan
AU - Brüning, Thomas
AU - Burwinkel, Barbara
AU - Buys, Saundra S.
AU - Byun, Jinyoung
AU - Cai, Qiuyin
AU - Cald, Trinidad És
AU - Caligo, Maria A.
AU - Campbell, Ian
AU - Canzian, Federico
AU - Caron, Olivier
AU - Carracedo, Angel
AU - Carter, Brian D.
AU - Esteban, Castelao
AU - Castera, Laurent
AU - Virginie, Caux Moncoutier
AU - Chan, Salina B.
AU - Jenny, Chang Claude
AU - Chanock, Stephen J.
AU - Chen, Xiaoqing
AU - Cheng, Ting Yuan David
AU - Chiquette, Jocelyne
AU - Christiansen, Hans
AU - Claes, Kathleen B.
AU - Clarke, Christine L.
AU - Conner, Thomas
AU - Conroy, Don M.
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AU - Cordina-Duverger, Emilie
AU - Cornelissen, Sten
AU - Coupier, Isabelle
AU - Cox, Angela
AU - Cox, David G.
AU - Cross, Simon S.
AU - Cuk, Katarina
AU - Cunningham, Julie M.
AU - Czene, Kamila
AU - Daly, Mary B.
AU - Damiola, Francesca
AU - Darabi, Hatef
AU - Davidson, Rosemarie
AU - Leeneer, Kim De L.
AU - Devilee, Peter
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AU - Diez, Orland
AU - Ding, Yuan Chun
AU - Ditsch, Nina
AU - Doheny, Kimberly F.
AU - Domchek, Susan M.
AU - Dorfling, Cecilia M.
AU - Dörk, Thilo
AU - Dos-Santos-Silva, Isabel
AU - Dubois, Stéphane
AU - Dugué, Pierre Antoine
AU - Dumont, Martine
AU - Dunning, Alison M.
AU - Durcan, Lorraine
AU - Dwek, Miriam
AU - Dworniczak, Bernd
AU - Eccles, Diana
AU - Eeles, Ros
AU - Ehrencrona, Hans
AU - Eilber, Ursula
AU - Ejlertsen, Bent
AU - Ekici, Arif B.
AU - Eliassen, A. Heather
AU - Engel, Christoph
AU - Eriksson, Mikael
AU - Fachal, Laura
AU - Faivre, Laurence
AU - Fasching, Peter A.
AU - Faust, Ulrike
AU - Figueroa, Jonine
AU - Flesch-Janys, Dieter
AU - Fletcher, Olivia
AU - Flyger, Henrik
AU - Foulkes, William D.
AU - Friedman, Eitan
AU - Fritschi, Lin
AU - Frost, Debra
AU - Gabrielson, Marike
AU - Gaddam, Pragna
AU - Gammon, Marilie D.
AU - Ganz, Patricia A.
AU - Gapstur, Susan M.
AU - Garber, Judy
AU - Garcia-Barberan, Vanesa
AU - Garciá-Saénz, José A.
AU - Gaudet, Mia M.
AU - Gauthier-Villars, Marion
AU - Gehrig, Andrea
AU - Georgoulias, Vassilios
AU - Gerdes, Anne Marie
AU - Giles, Graham G.
AU - Glendon, Gord
AU - Godwin, Andrew K.
AU - Goldberg, Mark S.
AU - Goldgar, David E.
AU - González-Neira, Anna
AU - Goodfellow, Paul
AU - Greene, Mark H.
AU - Grenaker, Grethe Alnæs I.
AU - Grip, Mervi
AU - Gronwald, Jacek
AU - Grundy, Anne
AU - Gschwantler, Daphne Kaulich
AU - Guénel, Pascal
AU - Guo, Qi
AU - Haeberle, Lothar
AU - Hahnen, Eric
AU - Haiman, Christopher A.
AU - Håkansson, Niclas
AU - Hallberg, Emily
AU - Hamann, Ute
AU - Hamel, Nathalie
AU - Hankinson, Susan
AU - Hansen, Thomas V.
AU - Harrington, Patricia
AU - Hart, Steven N.
AU - Hartikainen, Jaana M.
AU - Healey, Catherine S.
AU - Hein, Alexander
AU - Helbig, Sonja
AU - Henderson, Alex
AU - Heyworth, Jane
AU - Hicks, Belynda
AU - Hillemanns, Peter
AU - Hodgson, Shirley
AU - Hogervorst, Frans B.
AU - Hollestelle, Antoinette
AU - Hooning, Maartje J.
AU - Hoover, Bob
AU - Hopper, John L.
AU - Hu, Chunling
AU - Huang, Guanmengqian
AU - Hulick, Peter J.
AU - Humphreys, Keith
AU - Hunter, David J.
AU - Imyanitov, Evgeny N.
AU - Isaacs, Claudine
AU - Iwasaki, Motoki
AU - Izatt, Louise
AU - Jakubowska, Anna
AU - James, Paul
AU - Janavicius, Ramunas
AU - Janni, Wolfgang
AU - Jensen, Uffe Birk
AU - John, Esther M.
AU - Johnson, Nichola
AU - Jones, Kristine
AU - Jones, Michael
AU - Jukkola-Vuorinen, Arja
AU - Kaaks, Rudolf
AU - Kabisch, Maria
AU - Kaczmarek, Katarzyna
AU - Kang, Daehee
AU - Kast, Karin
AU - Keeman, Renske
AU - Kerin, Michael J.
AU - Kets, Carolien M.
AU - Keupers, Mac Hteld
AU - Khan, Sofia
AU - Khusnutdinova, Elza
AU - Kiiski, Johanna I.
AU - Kim, Sung Won
AU - Knight, Julia A.
AU - Konstantopoulou, Irene
AU - Kosma, Veli Matti
AU - Kristensen, Vessela N.
AU - Kruse, Torben A.
AU - Kwong, Ava
AU - Lænkholm, Anne Vibeke
AU - Laitman, Yael
AU - Lalloo, Fiona
AU - Lambrechts, Diether
AU - Landsman, Keren
AU - Lasset, Christine
AU - Lazaro, Conxi
AU - Marchand, Loic Le
AU - Al-Ejeh, Fares
AU - Margreet, G. M.Ausems
AU - Bacot, François
AU - Børresen-Dale, Anne Lise
AU - Bressac-De, Brigitte Paillerets
AU - Brooks-Wilson, Angela
AU - Castelao, J. Esteban
AU - Caux-Moncoutier, Virginie
AU - Chang-Claude, Jenny
AU - McLaes, Kathleen B.
AU - Dieter, Flesch Janys
AU - Gschwantler-Kaulich, Daphne
AU - Lecarpentier, Julie
AU - Lee, Andrew
AU - Lee, Eunjung
AU - Won, Jong Lee
AU - Lee, Min Hyuk
AU - Lejbkowicz, Flavio
AU - Lesueur, Fabienne
AU - Li, Jingmei
AU - Lilyquist, Jenna
AU - Lincoln, Anne
AU - Lindblom, Annika
AU - Lissowska, Jolanta
AU - Lo, Wing Yee
AU - Loibl, Sibylle
AU - Long, Jirong
AU - Loud, Jennifer T.
AU - Lubinski, Jan
AU - Luccarini, Craig
AU - Lush, Michael
AU - MacInnis, Robert J.
AU - Maishman, Tom
AU - Makalic, Enes
AU - Kostovska, Ivana Maleva
AU - Malone, Kathleen E.
AU - Siranoush, Manoukian
AU - Manson, Joann E.
AU - Margolin, Sara
AU - Martens, John W.
AU - Martinez, Maria Elena
AU - Matsuo, Keitaro
AU - Mavroudis, Dimitrios
AU - Mazoyer, Sylvie
AU - McLean, Catriona
AU - Meijers-Heijboer, Hanne
AU - Menéndez, Primitiva
AU - Meyer, Jeffery
AU - Miao, Hui
AU - Miller, Nicola
AU - Mitchell, Gillian
AU - Montagna, Marco
AU - Muir, Kenneth
AU - Mulligan, Anna Marie
AU - Mulot, Claire
AU - Nadesan, Sue
AU - Nathanson, Katherine L.
AU - Neuhausen, Susan L.
AU - Nevanlinna, Heli
AU - Nevelsteen, Ines
AU - Niederacher, Dieter
AU - Nielsen, Sune F.
AU - Nordestgaard, Børge G.
AU - Norman, Aaron
AU - Nussbaum, Robert L.
AU - Olah, Edith
AU - Olopade, Olufunmilayo I.
AU - Olson, Janet E.
AU - Olswold, Curtis
AU - Ong, Kai Ren
AU - Oosterwijk, Jan C.
AU - Orr, Nick
AU - Osorio, Ana
AU - Pankratz, V. Shane
AU - Papi, Laura
AU - Park-Simon, Tjoung Won
AU - Paulsson-Karlsson, Ylva
AU - Lloyd, Rachel
AU - Pedersen, Inge Søkilde
AU - Peissel, Bernard
AU - Peixoto, Ana
AU - Perez, Jose I.
AU - Peterlongo, Paolo
AU - Peto, Julian
AU - Pfeiler, Georg
AU - Phelan, Catherine M.
AU - Pinchev, Mila
AU - Plaseska-Karanfilska, Dijana
AU - Poppe, Bruce
AU - Porteous, Mary E.
AU - Prentice, Ross
AU - Presneau, Nadege
AU - Prokofieva, Darya
AU - Pugh, Elizabeth
AU - Pujana, Miquel Angel
AU - Pylkäs, Katri
AU - Rack, Brigitte
AU - Radice, Paolo
AU - Rahman, Nazneen
AU - Rantala, Johanna
AU - Rappaport-Fuerhauser, Christine
AU - Rennert, Gad
AU - Rennert, Hedy S.
AU - Rhenius, Valerie
AU - Rhiem, Kerstin
AU - Richardson, Andrea
AU - Rodriguez, Gustavo C.
AU - Romero, Atocha
AU - Romm, Jane
AU - Rookus, Matti A.
AU - Rudolph, Anja
AU - Ruediger, Thomas
AU - Saloustros, Emmanouil
AU - Sanders, Joyce
AU - Sandler, Dale P.
AU - Sangrajrang, Suleeporn
AU - Sawyer, Elinor J.
AU - Schmidt, Daniel F.
AU - Schoemaker, Minouk J.
AU - Schumacher, Fredrick
AU - Schürmann, Peter
AU - Schwentner, Lukas
AU - Scott, Christopher
AU - Scott, Rodney J.
AU - Seal, Sheila
AU - Senter, Leigha
AU - Seynaeve, Caroline
AU - Shah, Mitul
AU - Sharma, Priyanka
AU - Shen, Chen Yang
AU - Sheng, Xin
AU - Shimelis, Hermela
AU - Shrubsole, Martha J.
AU - Shu, Xiao Ou
AU - Side, Lucy E.
AU - Singer, Christian F.
AU - Sohn, Christof
AU - Southey, Melissa C.
AU - Spinelli, John J.
AU - Spurdle, Amanda B.
AU - Stegmaier, Christa
AU - Stoppa-Lyonnet, Dominique
AU - Sukiennicki, Grzegorz
AU - Surowy, Harald
AU - Sutter, Christian
AU - Swerdlow, Anthony
AU - Szabo, Csilla I.
AU - Tamimi, Rulla M.
AU - Tan, Yen Y.
AU - Taylor, Jack A.
AU - Tejada, Maria Isabel
AU - Tengström, Maria
AU - Teo, Soo H.
AU - Terry, Mary B.
AU - Tessier, Daniel C.
AU - Teul, Alex E.
AU - Thöne, Kathrin
AU - Thull, Darcy L.
AU - Tibiletti, Maria Grazia
AU - Tihomirova, Laima
AU - Tischkowitz, Marc
AU - Toland, Amanda E.
AU - Tollenaar, Rob A.M.
AU - Tomlinson, Ian
AU - Tong, Ling
AU - Torres, Diana
AU - Tranchant, Martine
AU - Truong, Thérèse
AU - Tucker, Kathy
AU - Tung, Nadine
AU - Tyrer, Jonathan
AU - Ulmer, Hans Ulrich
AU - Vachon, Celine
AU - Christi, Van Asperen J.
AU - Den Berg, David Van
AU - Ouweland, Ans M.Vanden
AU - Van Rensburg, Elizabeth J.
AU - Varesco, Liliana
AU - Varon-Mateeva, Raymonda
AU - Vega, Ana
AU - Viel, Alessandra
AU - Vijai, Joseph
AU - Vincent, Daniel
AU - Vollenweider, Jason
AU - Walker, Lisa
AU - Wang, Zhaoming
AU - Wang-Gohrke, Shan
AU - Wappenschmidt, Barbara
AU - Weinberg, Clarice R.
AU - Weitzel, Jeffrey N.
AU - Wendt, Camilla
AU - Wesseling, Jelle
AU - Whittemore, Alice S.
AU - Wijnen, Juul T.
AU - Willett, Walter
AU - Winqvist, Robert
AU - Wolk, Alicja
AU - Wu, Anna H.
AU - Xia, Lucy
AU - Yang, Xiaohong R.
AU - Yannoukakos, Drakoulis
AU - Zaffaroni, Daniela
AU - Zheng, Wei
AU - Zhu, Bin
AU - Ziogas, Argyrios
AU - Ziv, Elad
AU - Zorn, Kristin K.
AU - Gago-Dominguez, Manuela
AU - Mannermaa, Arto
AU - Olsson, Håkan
AU - Teixeira, Manuel R.
AU - Stone, Jennifer
AU - Offit, Kenneth
AU - Ottini, Laura
AU - Park, Sue K.
AU - Thomassen, Mads
AU - Hall, Per
AU - Meindl, Alfons
AU - Schmutzler, Rita K.
AU - Droit, Arnaud
AU - Bader, Gary D.
AU - Pharoah, Paul D.
AU - Couch, Fergus J.
AU - Easton, Douglas F.
AU - Kraft, Peter
AU - Chenevix-Trench, Georgia
AU - Garciá-Closas, Montserrat
AU - Antoniou, Antonis C.
AU - Simard, Jacques
N1 - Funding Information: We thank all the individuals who took part in these studies and all the researchers, clinicians, technicians and administrative staff who have enabled this work to be carried out. Genotyping for the OncoArray was funded by the government of Canada through Genome Canada and the Canadian Institutes of Health Research (GPH-129344), the Ministère de l’Économie, de la Science et de l’Innovation du Québec through Génome Québec, the Quebec Breast Cancer Foundation for the PERSPECTIVE project, the US National Institutes of Health (NIH) (1 U19 CA 148065 for the Discovery, Biology and Risk of Inherited Variants in Breast Cancer (DRIVE) project and X01HG007492 to the Center for Inherited Disease Research (CIDR) under contract HHSN268201200008I), Cancer Research UK (C1287/A16563), the Odense University Hospital Research Foundation (Denmark), the National R&D Program for Cancer Control–Ministry of Health and Welfare (Republic of Korea) (1420190), the Italian Association for Cancer Research (AIRC; IG16933), the Breast Cancer Research Foundation, the National Health and Medical Research Council (Australia) and German Cancer Aid (110837). Genotyping for the iCOGS array was funded by the European Union (HEALTH-F2-2009-223175), Cancer Research UK (C1287/A10710, C1287/A10118 and C12292/A11174]), NIH grants (CA128978, CA116167 and CA176785) and the Post-Cancer GWAS initiative (1U19 CA148537, 1U19 CA148065 and 1U19 CA148112 (GAME-ON initiative)), an NCI Specialized Program of Research Excellence (SPORE) in Breast Cancer (CA116201), the Canadian Institutes of Health Research (CIHR) for the CIHR Team in Familial Risks of Breast Cancer, the Ministère de l’Économie, Innovation et Exportation du Québec (PSR-SIIRI-701), the Komen Foundation for the Cure, the Breast Cancer Research Foundation and the Ovarian Cancer Research Fund. Combination of the GWAS data was supported in part by the NIH Cancer Post-Cancer GWAS initiative (1 U19 CA 148065) (DRIVE, part of the GAME-ON initiative). LD score regression analysis was supported by grant CA194393. BCAC is funded by Cancer Research UK (C1287/A16563) and by the European Union via its Seventh Framework Programme (HEALTH-F2-2009-223175, COGS) and the Horizon 2020 Research and Innovation Programme (633784, B-CAST; 634935, BRIDGES). CIMBA is funded by Cancer Research UK (C12292/A20861 and C12292/A11174). For a full description of funding and acknowledgments, see the Supplementary Note.
PY - 2017/12/1
Y1 - 2017/12/1
N2 - Most common breast cancer susceptibility variants have been identified through genome-wide association studies (GWAS) of predominantly estrogen receptor (ER)-positive disease1. We conducted a GWAS using 21,468 ER-negative cases and 100,594 controls combined with 18,908 BRCA1 mutation carriers (9,414 with breast cancer), all of European origin. We identified independent associations at P < 5 × 10-8 with ten variants at nine new loci. At P < 0.05, we replicated associations with 10 of 11 variants previously reported in ER-negative disease or BRCA1 mutation carrier GWAS and observed consistent associations with ER-negative disease for 105 susceptibility variants identified by other studies. These 125 variants explain approximately 16% of the familial risk of this breast cancer subtype. There was high genetic correlation (0.72) between risk of ER-negative breast cancer and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers. These findings may lead to improved risk prediction and inform further fine-mapping and functional work to better understand the biological basis of ER-negative breast cancer.
AB - Most common breast cancer susceptibility variants have been identified through genome-wide association studies (GWAS) of predominantly estrogen receptor (ER)-positive disease1. We conducted a GWAS using 21,468 ER-negative cases and 100,594 controls combined with 18,908 BRCA1 mutation carriers (9,414 with breast cancer), all of European origin. We identified independent associations at P < 5 × 10-8 with ten variants at nine new loci. At P < 0.05, we replicated associations with 10 of 11 variants previously reported in ER-negative disease or BRCA1 mutation carrier GWAS and observed consistent associations with ER-negative disease for 105 susceptibility variants identified by other studies. These 125 variants explain approximately 16% of the familial risk of this breast cancer subtype. There was high genetic correlation (0.72) between risk of ER-negative breast cancer and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers. These findings may lead to improved risk prediction and inform further fine-mapping and functional work to better understand the biological basis of ER-negative breast cancer.
UR - https://www.scopus.com/pages/publications/85035773185
U2 - 10.1038/ng.3785
DO - 10.1038/ng.3785
M3 - Article
C2 - 29058716
AN - SCOPUS:85035773185
SN - 1061-4036
VL - 49
SP - 1767
EP - 1778
JO - Nature Genetics
JF - Nature Genetics
IS - 12
ER -