Minería de datos genómicos de la cepa Galdieria sp. USBA-GBX-832, para identificación de rutas biosintéticas de metabolitos secundarios asociadas a ácidos grasos poliinsaturados.

Durante las investigaciones de la Unidad de Saneamiento y Biotecnología Ambiental (USBA), en el Centro de Excelencia en Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos (Gebix) entre 2008 y 2014 se realizaron diferentes aislamientos microbianos a partir de manantiales termales ácidos del Parque Natural Nacional Los Nevados (PNN Los Nevados). Dentro de estos aislamientos se destaca la microalga termoacidófila Galdieria USBA-GBX-832, que presenta características particulares como crecimiento mixotrófico y heterotrófico sobre diferentes sustratos lipídicos como aceite de oliva y tricaprilina y actividad enzimática lipolítica en sustratos p-nitrofenoles de cadena media a larga. Hasta la fecha no se ha reportado esta actividad enzimática en ninguna especie del género Galdieria, pero en un estudio genómico más reciente realizado por Schoenknecht et al. (2013) en Galdieria sulphuraria cepa 074W, se identificaron genes relacionados con lipasas, esterasas y con enzimas tipo desaturasas y elongasas, implicadas en la biosíntesis de PUFA (Sasso et al 2012). Por lo tanto, la habilidad de producción y acumulación de ácidos grasos saturados y poliinsaturados, la evidencia de la presencia de enzimas tipo desaturasas y elongasas en organismos del género Galdieria (Schoenknecht et al., 2013), y particularmente la capacidad de Galdieria USBA-GBX-832 de crecer sobre sustratos lipídicos, hacen de esta cepa una candidata para dilucidar a través del genoma novedosas rutas biosintéticas asociadas a la generación de PUFA. Teniendo en cuenta el potencial metabólico de Galdieria USBA-GBX-832, y los datos del genoma de la misma obtenidos como producto de las actividades del GEBIX proyectados para el año 2014, es de interés en este proyecto identificar a través de minería de datos genómicos: 1) rutas biosintéticas de metabolitos secundarios asociadas a ácidos grasos poliinsaturados esenciales y 2) enzimas asociadas a la transformación de aceites y grasas. Y 3) una vez dilucidados estos dos componentes, se identificarán variables de crecimiento asociados a la expresión de estos ácidos grasos y enzimas asociadas a la transformación de aceites y grasas directamente en Galdieria USBA-GBX-832.