Efecto del protocolo de extracción de DNA y el uso de DGGE sobre la estimación de la diversidad bacteriana en suelos de sistemas silvopastoriles.

Aunque es ampliamente aceptado que las bacterias constituyen un gran componente de la biomasa y de la diversidad en la tierra y tienen un papel indispensable en el mantenimiento de la vida y los ciclos biogeoquímicos, todavía no se conocen todos los factores que afectan la diversidad, la composición y la estructura de las comunidades microbianas, ni la forma como esta diversidad puede afectar el funcionamiento de los ecosistemas. Las dos razones principales para este vacío de información es la complejidad del tema (p.e. los numerosos factores que afectan la enorme diversidad microbiana y sus actividades) y los problemas metodológicos empleados para su estudio. Esta propuesta busca explorar 2 aspectos que afectan la ¿visualización¿ de la diversidad bacteriana: 1. La extracción de DNA a partir de muestras de suelo; y 2. La medición de la diversidad bacteriana (DGGE vs. pirosecuenciación). Finalmente, este estudio brindará información más detallada sobre el efecto que tiene el manejo agrícola sobre la comunidad bacteriana del suelo en la reserva natural El Hatico.