Análisis genómico de aislamientos colombianos de Helicobacter pylori para la identificación y caracterización de profagos

Helicobacter pylori es un patógeno capaz de colonizar y persistir en el estómago humano, la infección por esta bacteria se asocia con gastritis o condiciones más severas, como úlcera péptica, adenocarcinoma y linfoma gástrico tipo MALT. H. pylori ha sido descrita como una bacteria genéticamente diversa, condición que puede estar influenciada por la presencia de elementos genómicos móviles, entre ellos, los profagos. Estos elementos corresponden a secuencias de fagos insertadas en el genoma bacteriano que pueden funcionar como reservorios genéticos que proporcionan beneficios a los patógenos, sin embargo, las maneras en las que funcionan apenas están empezando a determinarse. Los reportes acerca de la relación de estas partículas con H. pylori han permitido conocer que existen profagos insertados en diferentes cepas, que aportan a la diversidad genética de H. pylori y que posiblemente participan en la virulencia y la adaptación de la bacteria a su particular nicho ecológico. Este proyecto busca determinar la presencia de secuencias profagos en el genoma de cepas colombianas de H. pylori, para ello se realizará un tamizaje inicial por PCR para los genes de la integrasa y holin, responsables de la inserción del profago en el genoma bacteriano, la cual se aplicará a 100 cepas pertenecientes a la colección de microorganismos de la PUJ, de aquellas cepas que resulten positivas para estos genes, se seleccionarán diez (10) para secuenciación completa del genoma. Los resultados permitirán determinar la presencia de profagos en las cepas de origen colombiano y caracterizar estos profagos para conocer más acerca del papel de los profagos en la virulencia y la patogenicidad de H. pylori, así mismo permitirán comparar los genomas de los profagos y de las bacterias con los previamente descritos en otras regiones del mundo para establecer relaciones filogeográficas.