Johan Andrés Nieto se encuentra vinculado a la Pontificia Universidad Javeriana desde el año 2024 y actualmente es profesor asistente del Departamento de Teología. Desarrolla labores de docencia en los programas académicos de la facultad y de investigación en el campo de la mistagogía, la pedagogía de la teología y el método teológico anagógico.

Ha desarrollado diversas invesigaciones en temas de Teología, educación, desarrollo humano, educación popular y metodología de la investigación. 

Así mismo, se ha desempeñado como par académico de MinCiencias y del Ministerio de Educación. Evaluador de diferentes publicaciones científicas en el ámbito nacional e internacional. Asesor teológico en temas eclesiásticos, formación sacerdotal, religiosa y laical. 

Los principales intereses de investigación incluyen: la mistagogía como pedagogía de la teología, liturgia y sacramentalidad, formación del laicado, educación popular, desarrollo humano, narratividad y metodología de la investigación.

El profesor ha publicado a lo largo de los años un número considerable de artículos, libros y capítulos de libro originales (con más de 1317 citas) en revistas internacionales revisadas por pares de gra reputación. 

El profesor es revisor de revistas Scopus, WOS, Publindex y presentes en otras bases de indexación, en los temas de teología, sacramentología, pedagogía de la teología, mistagogía, padres de la Iglesia, educación popular, didáctica, desarrollo humano, método narrativo y metodología de la investigación.