Miguel Andrés Otálora Baquero se encuentra vinculado a la Pontificia Universidad Javeriana desde el año 2015 y al Hospital Universitario San Ignacio desde el año 2003 y actualmente es profesor instructor del Departamento de Pediatría. Desarrolla labores de docencia en los programas de pregrado de medicina, postgrados de especialización en pediatría y especialización en neonatología y de investigación en el campo de la neonatología. 

Ha desarrolado investigación en temas de enterocolitis necrosante, curvas de crecimiento prenatal y postnatal y participa en proyectos de investigacion de otros pares en el departamento. Ha sido coordinador de las rotaciones de pregrado en la unidad de recién nacidos del Hospital Universitario San Ignacio.  

Los principales intereses del profesor incluyen el cuidado de recien nacidos con patologías cardiovasculares, manejo pre y postoperatorio de pacientes con cardiopatías congénitas y el soporte de vida extracorpórea (ECMO) contando con certificación en la materia por parte de la ELSO (Extracorporeal Life Support Organizaton), así como temas de ventilación mecánica en recien nacidos y diagnóstico y manejo de enterocolotis necrosante neonatal.