Karen Sarmiento, se encuentra vinculada a la Pontificia Universidad Javeriana desde el año 2015 y actualmente es profesora asistente del Departamento de Ciencias Fisiológicas de la Facultad de Medicina. Desarrolla labores de docencia en pregrado de Medicina, Química Farmacéutica, Enfermería, Nutrición y Bacteriología, así como en posgrado en la Especialización y en la Maestría en Seguridad y Salud en el Trabajo.

Ha desarrollado investigación en diferentes áreas de ciencias de la salud básica y aplicada, principalmente en temas de Anomalías congénitas, Enfermedades huérfanas, Salud pública, Genética, Teratógenos, farmacología, Toxicología clínica y Toxinología de venenos de animales, ofidismo, antivenenos antiofídicos. 

Así mismo, se ha desempeñado como consultor de la OMS/OPS en las epidemias por arbovirosis (ZIKV - OROV), ha ejecutado cargos en el Ministerio de Salud en el área de Urgencias Toxicológicas; Consultor como Médico Toxicólogo ocupacional experto en SURA desde Fundación para la Gestión del Riesgo, 

Los principales intereses de investigación del profesor incuyen las Anomalías congénitas, sustancias teratogénicas, Toxicología básica y clínica y Sueros antiofídicos. Coinvestigadora del grupo del Estudio Colaborativo Latinoamericano de Malformaciones Congénitas (ECLAMC) y del Instituto de Genética Humana (IGH).

Ha publicado a lo largo de los años un número considerable de artículos originales en revistas internacionales y nacionales indexadas, revisadas por pares de gran reputación.