Amanda Varela Ramírez se encuentra vinculada a la Pontificia Universidad Javeriana desde el año 1994 y actualmente es Profesora Titular del Departamento de Biología. Desarrolla labores de docencia en el Programa de Biología y en el de Microbiología Industrial. También participa como docente en el programa en la Maestría y Doctorado en Ciencias Biológicas de la Facultad de Ciencias. Desarrolla investigación en ecología funcional de suelos y en control biológico utilizando microorganismos.

Ha desarrollado diversas investigaciones en procesos edáficos modificados por perturbaciones antrópicas (cambio de uso de suelo, cambio climático global) y naturales (inundaciones, incendios) sobre el funcionamiento del ecosistema y las comunidades microbianas, usos de biochar en techos verdes, agricultura y rehabilitación de suelos, diversidad funcional microbiana y su potencial de aplicación, patología vegetal en ecosistemas naturales. Ha sido Coordinadora del grupo de investigación Unidad de Ecología y Sistemática (UNESIS), Presidente de la Sociedad Colombiana de Entomología, miembro fundador de la Asociación Colombiana de Micología y de International Conservation Fungal Society. Dirige el Laboratorio de ecología de Suelos y Hongos Tropicales.

El interés central en investigación de la profesora está relacionado con ecología funcional de suelos en ambientes naturales y antrópicos.

La profesora ha publicado artículos en revistas nacionales, internacionales y capítulos de libros. Forma parte de organizaciones científicas nacionales e internacionales en micología, suelos, entomología y zoología.