Comparación de cuatro métodos de restauración del adn en muestras de plasma y láminas de citología cérvico-uterina como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra

Pilar Caterin  Márquez; Dabeiba Adriana Garcia Robayo; Marcos Castillo; Ignacio Briceño; Jairo  Amaya; Fabio Ancízar Aristizábal

Comparación de cuatro métodos de restauración del adn en muestras de plasma y láminas de citología cérvico-uterina como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra

Translated title of the contribution: Comparison of four methods of dna restoration in samples from plasma and pap smears as a tool for better the samples.

Pilar Caterin Márquez, Dabeiba Adriana Garcia Robayo, Marcos Castillo, Ignacio Briceño, Jairo Amaya, Fabio Ancízar Aristizábal

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

Abstract

Objetives: To compare four methods of restoration of dna in plasma and pap smears as a tool to improve the quality of the samples. Methods: 20 blood samples and 20 pap smears samples, we performed dna isolation by commercial kit and phenol-chloroform respectively. Then all samples underwent a pre-pcr treatment with four different types of activity dna polymerase: 1. Exonuclease and endonuclease 5’-3’. 2. Exonuclease 5’-3’. 3. Klenow, and 4. Klenow more ligase. Different restoration methods were evaluated quantitatively by real-time pcr with gene alu. Results: All restoration methods improve the quality of dna in both types of samples. However, the 3th method showed better results in both plasma and pap smears, increasing the concentration of dna from 0.0022 ng/mL to 0.6474 ng/mL in pap smears and 0.0039 ng/mL to 0.435 ng/mL in blood plasma. Conclusions: dna from plasma samples and pap smears to be treated with a restoration process increases the quality of dna compared to untreated samples.

Translated title of the contribution	Comparison of four methods of dna restoration in samples from plasma and pap smears as a tool for better the samples.
Original language	Spanish
Pages (from-to)	18-200
Journal	Revista Colombiana de Ciencias Qúımico-Farmacéuticas
Volume	40
Issue number	2
State	Published - 2011

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abstract = "Objetivos: comparar cuatro m{\'e}todos de restauraci{\'o}n del adn en plasma y l{\'a}minas c{\'e}rvico-uterinas como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra. M{\'e}todos: a 20 muestras de plasma sangu{\'i}neo y 20 muestras de l{\'a}minas citol{\'o}gicas, se les realiz{\'o} aislamiento de adn mediante kit comercial y fenol-cloroformo. A todas las muestras se les realiz{\'o} un tratamiento pre-pcr con cuatro diferentes tipos de actividad de adn polimerasa: 1. Exonucleasa y endonucleasa 5{\textquoteright}-3{\textquoteright}. 2. Exonucleasa 5{\textquoteright}-3{\textquoteright}. 3. Klenow, y 4. Klenow m{\'a}s ligasa. Los diferentes m{\'e}todos se evaluaron mediante pcr en tiempo real con el gen alu. Resultados: todos los m{\'e}todos de restauraci{\'o}n mejoran la calidad del adn en los dos tipos de muestras. El m{\'e}todo 3 mostr{\'o} mejores resultados en plasma y en l{\'a}mina, incrementando la concentraci{\'o}n del adn de 0,0022 ng/μL a 0,6474 ng/μL en l{\'a}minas de citolog{\'i}a y de 0,0039 ng/μL a 0,435 ng/ μL en plasma sangu{\'i}neo. Conclusiones: adn de las muestras de plasma y l{\'a}mina al ser tratadas con un proceso de restauraci{\'o}n aumenta la calidad del adn en comparaci{\'o}n a las muestras no tratadas.",

author = "M{\'a}rquez, {Pilar Caterin} and {Garcia Robayo}, {Dabeiba Adriana} and Marcos Castillo and Ignacio Brice{\~n}o and Jairo Amaya and Aristiz{\'a}bal, {Fabio Anc{\'i}zar}",

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Comparación de cuatro métodos de restauración del adn en muestras de plasma y láminas de citología cérvico-uterina como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra. / Márquez, Pilar Caterin ; Garcia Robayo, Dabeiba Adriana; Castillo, Marcos et al.
In: Revista Colombiana de Ciencias Qúımico-Farmacéuticas, Vol. 40, No. 2, 2011, p. 18-200.

Research output: Contribution to journal › Article › peer-review

TY - JOUR

T1 - Comparación de cuatro métodos de restauración del adn en muestras de plasma y láminas de citología cérvico-uterina como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra

AU - Márquez, Pilar Caterin

AU - Garcia Robayo, Dabeiba Adriana

AU - Castillo, Marcos

AU - Briceño, Ignacio

AU - Amaya, Jairo

AU - Aristizábal, Fabio Ancízar

PY - 2011

Y1 - 2011

N2 - Objetivos: comparar cuatro métodos de restauración del adn en plasma y láminas cérvico-uterinas como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra. Métodos: a 20 muestras de plasma sanguíneo y 20 muestras de láminas citológicas, se les realizó aislamiento de adn mediante kit comercial y fenol-cloroformo. A todas las muestras se les realizó un tratamiento pre-pcr con cuatro diferentes tipos de actividad de adn polimerasa: 1. Exonucleasa y endonucleasa 5’-3’. 2. Exonucleasa 5’-3’. 3. Klenow, y 4. Klenow más ligasa. Los diferentes métodos se evaluaron mediante pcr en tiempo real con el gen alu. Resultados: todos los métodos de restauración mejoran la calidad del adn en los dos tipos de muestras. El método 3 mostró mejores resultados en plasma y en lámina, incrementando la concentración del adn de 0,0022 ng/μL a 0,6474 ng/μL en láminas de citología y de 0,0039 ng/μL a 0,435 ng/ μL en plasma sanguíneo. Conclusiones: adn de las muestras de plasma y lámina al ser tratadas con un proceso de restauración aumenta la calidad del adn en comparación a las muestras no tratadas.

AB - Objetivos: comparar cuatro métodos de restauración del adn en plasma y láminas cérvico-uterinas como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra. Métodos: a 20 muestras de plasma sanguíneo y 20 muestras de láminas citológicas, se les realizó aislamiento de adn mediante kit comercial y fenol-cloroformo. A todas las muestras se les realizó un tratamiento pre-pcr con cuatro diferentes tipos de actividad de adn polimerasa: 1. Exonucleasa y endonucleasa 5’-3’. 2. Exonucleasa 5’-3’. 3. Klenow, y 4. Klenow más ligasa. Los diferentes métodos se evaluaron mediante pcr en tiempo real con el gen alu. Resultados: todos los métodos de restauración mejoran la calidad del adn en los dos tipos de muestras. El método 3 mostró mejores resultados en plasma y en lámina, incrementando la concentración del adn de 0,0022 ng/μL a 0,6474 ng/μL en láminas de citología y de 0,0039 ng/μL a 0,435 ng/ μL en plasma sanguíneo. Conclusiones: adn de las muestras de plasma y lámina al ser tratadas con un proceso de restauración aumenta la calidad del adn en comparación a las muestras no tratadas.

UR - http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0034-74182011000200004

UR - https://revistas.unal.edu.co/index.php/rccquifa/article/view/45582

M3 - Artículo

SN - 1909-6356

VL - 40

SP - 18

EP - 200

JO - Revista Colombiana de Ciencias Qúımico-Farmacéuticas

JF - Revista Colombiana de Ciencias Qúımico-Farmacéuticas

IS - 2

ER -

Comparación de cuatro métodos de restauración del adn en muestras de plasma y láminas de citología cérvico-uterina como una herramienta para mejorar la calidad de la muestra

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