Análisis integrativo del microbioma y transcriptoma presente en placa dental, saliva y tejido tumoral en carcinoma oral y su relación con el metaboloma microbiano determinado en saliva

El cáncer oral escamocelular (COE) ocupa el sexto lugar en frecuencia por cáncer a nivel mundial, se ha asociado en un 80% a factores de riesgo como el consumo excesivo de alcohol y cigarrillo y el 20% restante a infecciones virales como la del Virus del Papiloma Humano (VPH). Por otro lado, algunos estudios han descrito que la higiene oral deficiente se correlaciona con enfermedades complejas como el cáncer oral. Gracias a estudios de DNA en tejido tumoral por secuenciación de alto rendimiento en COE, recientemente algunas bacterias a nivel de especie como Streptococcus anginosus, Micrococcus luteus y Prevotella melaninogenica, se han asociado a dicha patología, en comparación con personas sin cáncer oral o tejidos no tumorales. Por lo cual, en un estudio previo realizado por nosotros describimos mediante análisis de metagenoma las especies bacterianas relacionadas a procesos tumorales en esta patología, y encontradas de manera simultánea en saliva o en placa dental. (Manuscrito en preparación). Adicionalmente, aprovechando el DNA extraído de las muestras de tejido tumoral, describimos la presencia o no del VPH, mediante PCR y tipificación viral mediante Luminex® artículo publicado por nosotros Erira y colaboradores; 2016, con el fin de cubrir el mayor número de posibilidades en la etiología infecciosa del COE. Por otro lado, recientemente, se sugiere que la descripción de la composición de comunidades microbianas no es suficiente para relacionarlas a procesos carcinogénicos, ya que se hace necesario realizar estudios de actividad funcional de microbiomas en nichos particulares. En el presente estudio, se incluirán todas las muestras previamente recolectadas (estudio de metagenoma bacteriano) (saliva, placa dental y tejido tumoral) para pacientes con diagnóstico de COE y muestras de (saliva y placa dental) de personas sin COE, para realizar estudios de metatranscriptoma bacteriano y correlacionar los datos metagenómicos bacteriano previamente obtenido y datos metatranscriptómicos del microbioma oral mediante secuenciación de alto rendimiento. Esto con el fin, de completar la tesis doctoral titulada ¿El microbioma en distintos microambientes bucales: comparación del metagenoma y metatranscriptoma presente en placa dental, saliva y tejido tumoral de pacientes con cáncer oral escamocelular¿, que deriva del proyecto marco ¿Análisis integrativo del microbioma y transcriptoma presente en placa dental, saliva y tejido tumoral en carcinoma oral y su relación con el metaboloma microbiano determinado en saliva¿, del cual a la fecha no se cuenta con el total de la financiación. El desarrollo del presente proyecto, llevará a tener un mejor entendimiento del papel protagónico que juegan las bacterias en COE, para proponer un modelo complejo etiológico, en esta patología y relacionarlo a los distintos microambientes de la cavidad bucal.